MoDyS relève de la section 36 du Comité national du CNRS (normes et règles). Administrativement régi par une convention entre le CNRS, l'Université Lumière Lyon 2 et l'Université Jean Monnet Saint-Etienne, Modys est localisé sur deux sites, l'Institut des Sciences de l'Homme de Lyon et  le Campus Tréfilerie de l'Université Jean Monnet Saint-Etienne.

Université Lumière Lyon 2

Les premières institutions lyonnaises à caractère universitaire ont émergé au cours  premier tiers du XIXe siècle : la faculté de Science en 1834 et des Lettres en 1838 puis la faculté de droit en 1875 et la faculté mixte de médecine et de pharmacie en 1877. Avec la loi Liard de 1896, les quatre facultés sont rassemblées sous l'unique intitulé d'« Université de Lyon ». La loi Faure adoptée à la suite des mouvements sociaux de 1968 provoque la scission de l'Université de Lyon en trois universités. Parmi elles, l'Université Lyon 2, qui regroupe le droit, les lettres et les sciences humaines. En 1987, l'Université rend hommage aux frères Lumière et devient l'Université Lumière Lyon 2.

Au 15 janvier 2009, l'Université Lyon 2 accueillait  26679 étudiants

au sein de 6 facultés, 7 instituts et 2 départements de formation.  Elle dispense des enseignements dans 3 grands domaines :

• Arts, lettres, langues

• Droit, économie gestion

• Sciences humaines et sociales.

Les étudiants peuvent suivre les enseignements de 36 parcours de Licence et 195 parcours de Master.

Sur le plan de la recherche, elle compte 36 laboratoires de recherche, dont 20 UMR associées au CNRS,  7 écoles doctorales et 39 doctorats.

Université Jean Monnet Saint-Etienne

C'est au début des années soixante que se développe à Saint-Etienne un enseignement supérieur universitaire. Le 27 mars 1969, l'Université de Saint-Etienne est officiellement créée.

Dès l'origine, elle met en place  des enseignements universitaires classiques, ce qui lui permet de présenter aujourd'hui la quasi totalité des disciplines et filières professionnalisées. Le début de la décennie 90 voit en particulier la création d'une école d'ingénieurs et d'un deuxième IUT à Roanne, en plus de celui de Saint-Etienne, ainsi que de nombreux diplômes professionnels de second et troisième cycles.

Depuis l'origine également, elle fait porter ses efforts sur la formation permanente et définit en matière de recherche des créneaux originaux dans le contexte de la Région Rhône-Alpes.

En 1989, elle prend le nom de Jean Monnet, un des pères de l'Europe. Elle dispense ses enseignements (parcours LMD) dans 4 domaines :

• Arts, lettres, langues

• Droit, économie gestion

• Sciences humaines et sociales.

• Sciences, technologies, santé

Le PRES Université de Lyon

Après plus de dix années de dialogue, d'échanges, de coordination et de conduites de projets, les établissements de Lyon ont franchi un cap décisif dans la construction d'une identité commune et la mise en place d'une politique concertée en matière de recherche et d'enseignement supérieur sur le site.

Le Décret en date du 21 mars 2007 portant création de l'établissement public de coopération scientifique « Université de LYON »,  a signé la naissance officielle du pôle de recherche et d'enseignement supérieur  de Lyon. L'Université Lumière Lyon 2 et l'Université Jean Monnet Saint-Etienne font partie des membres fondateurs.